Med trstičjem in ostalim vodnimi rastlinjem lahko pozoren obiskovalec najprej opazi žabo debeloglavko (Rana ridibunda), najpogostejšo vrsto dvoživke v Škocjanskem zatoku. Poleg nje se v rezervatu pojavljajo še zelena krastača (Bufo viridis), navadna krastača (Bufo bufo), rosnica (Rana dalmatina) in zelena rega (Hyla arborea).
Debeloglavka (Rana ridibunda) spada v skupino zelenih žab, za katere je značilno, da vse življenje preživijo v vodi ali v njeni neposredni bližini, kjer se razmnožujejo, prehranjujejo in prezimujejo. V obdobju parjenja se samci smejoče oglašajo s pomočjo parnih zvočnih mehurjev, ki se izvihata ob kotičkih ust in tako privabljajo samice.
Zelena krastača (Bufo viridis) je termofilna in evrihalina vrsta, kar pomeni, da sodi med vrste, ki se prilagajajo različni slanosti. Pojavlja se tako v sladkovodnih kot tudi brakičnih vodah Škocjanskega zatoka.