Nella zona d’acqua dolce di Val Stagnon sono presenti numerose pozzanghere e canali colonizzati da svariate specie di invertebrati, anfibi e rettili. Per i visitatori sono particolarmente interessanti i fossi e le pozze situate lungo il percorso didattico circolare. In essi abbonda ogni tipo di vita, le libellule sono le più numerose. Ci sono diverse specie di serpenti, girini di rane, tritoni, il cui ciclo vitale, molto vario e interessante, si svolge sia in ambienti acquatici sia su quelli terrestri.