Odbor za naravni rezervat je na svoji 13. redni seji 28.11.2016 v Škocjanskem zatoku potrdil predlog Letnega programa dela Naravnega rezervata Škocjanski zatok za leto 2017, ki je tako postal podlaga za letno financiranje upravljanja s strani države.

Prioritete programa so povezane predvsem z ukrepi za ohranjanje habitatov in vrst Škocjanskega zatoka ter nadgradnjo programov obiskovanja območja, pa tudi z zmanjševanjem vplivov urbane okolice na naravni rezervat in s tem tudi na doživljanje narave s strani obiskovalcev.