V to skupino sodijo negnezdeče vrste, ki se v naravnem rezervatu najštevilčnejše pojavljajo v zimskem času (od sredine novembra do sredine februarja). To so predvsem vrste, ki praviloma gnezdijo severno od naših krajev. Med zimske goste uvrščamo 42 vrst ptic, opaženih v Škocjanskem zatoku.
 Kajetan Kravos |
 Borut Mozetič |
 Borut Mozetič |
 Borut Mozetič |
 Kajetan Kravos |
 Kajetan Kravos |
Seznam zimskih gostov:
rdečegrli slapnik (Gavia stellata)
pritlikavi kormoran (Phalacrocorax pygmeus)
bobnarica (Botaurus stellaris)
siva gos (Anser anser)
njivska gos (Anser fabalis)
beločela gos (Anser albifrons)
mala gos (Anser erythropus)
rdečevrata gos (Branta ruficollis)
žvižgavka (Anas penelope)
konopnica (Anas strepera)
raca žličarica (Anas clypeata)
kreheljc (Anas crecca)
sivka (Aythya ferina)
čopasta črnica (Aythya fuligula)
zvonec (Bucephala clangula)
mali žagar (Mergellus albellus)
pepelasti lunj (Circus cyaneus)
mali sokol (Falco columbarius)
žerjav (Grus grus)
sloka (Scolopax rusticola)
puklež (Lymnocryptes minimus)
sivi galeb (Larus canus)
kričava čigra (Sterna sandvicensis)
močvirska uharica (Asio flammeus)
vodomec (Alcedo atthis)
poljski škrjanec (Alauda arvensis)
vriskarica (Anthus spinoletta)
travniška cipa (Anthus pratensis)
stržek (Troglodytes troglodytes)
siva pevka (Prunella modularis)
taščica (Erithacus rubecula)
šmarnica (Phoenicurus ochruros)
brinovka (Turdus pilaris)
carar (Turdus viscivorus)
rumenoglavi kraljiček (Regulus regulus)
brkata sinica (Panurus biarmicus)
menišček (Parus ater)
veliki srakoper (Lanius excubitor)
travniški vrabec (Passer hispaniolensis)
pinoža (Fringilla monrifringilla)
rumeni strnad (Emberiza citrinella)
trstni strnad (Emberiza schoeniclus)
