Od večjih sesalcev v Škocjanskem zatoku živijo:
poljski zajec (Lepus europaeus)
beloprsi jež (Erinaceus concolor)
nutrija (Myocastor coypus) - neavtohtona vrsta
lisica (Vulpes vulpes)
Od malih sesalcev pa so prisotni naslednji (najdeni v izbljuvkih pegaste sove):
navadna belonoga miš (Apodemus sylvaticus)
dimasta miš (Apodemus agrarius)
pritlikava miš (Micromys minutus)
črna podgana (Rattus rattus)
siva podgana (Rattus norvegicus)
vrtna rovka (Crocidura suaveolens)
poljska rovka (Crocidura leucodon)
etruščanska rovka (Suncus etruscus)
Igor Brajnik
Mirko Kastelic
Borut Mozetič
